Чашечка, поддерживающая цветок, слегка согнутая, с пятью зубцами, из которых верхний длиннее остальных. Нижняя губа светло-пурпурного венчика с пурпурными крапинками, по краям городчато-зубчатая.

Цветет котовник почти все лето, активно посещается пчелами. Сбор меда с одного гектара зарослей котовника достигает не менее 400 кг за сезон.

Эфирное масло, выделяемое из этого растения, обладает высокой антигрибковой активностью. Благодаря антимикробному действию котовник используется наружно при гнойных процессах кожи, а также и для борьбы с паразитами (проявляя инсектицидное действие). Применяют котовник при хронических бронхитах, для успокоения кашля, при желудочно-кишечных заболеваниях.

Котовник лимонный обладает спазмолитическим действием, повышает общий тонус, улучшает аппетит, устраняет чувство головокружения. Чай из этого растения считается даже более вкусным, чем травяной настой из мелиссы. Имеются данные о желчегонном действии котовника.

Один из способов приготовления и применения: 1—2 столовые ложки сухого измельченного сырья (верхней части цветущих побегов) залить 200 мл кипятка. Выдержать 2 часа и пить после процеживания в теплом виде по одной рюмке (50 мл) 3 раза в день перед едой.