Листья светло-зеленые, с клиновидным основанием, трехрассе-ченные на узкие продолговато-ромбические доли, в свою очередь перисторассеченные на линейные трехраздельные дольки. В пределах соцветия (то есть на верхушках цветущих побегов) листья в очертании ромбические, трехрассеченные на узколинейные доли; нижние листья рано отмирают.

Соцветия длинные, с расставленными мутовками; чашечка труб-чато-колокольчатая. Розовые цветки длиной 1,5 см со шлемовидной верхней губой. Цветет в июле — августе, выделяя обильный нектар.

Распространен на Алтае и в Восточной Сибири (Даурия), в Китае и Монголии.

В тибетской медицине пустырник сибирский известен под названием gan-ga-chkhung (ган-га-чхунг).

В Китае этот вид пустырника называют i-mu-tsao (и-му-цао) и используют при лечении бесплодия, для стимуляции кроветворения и регуляции менструальных циклов. Обладает кровоостанавливающими свойствами и облегчает боли в области матки.

Цветки пустырника сибирского применяются в тибетской медицине при расстройствах желудка и кишечника, сопровождающихся значительным повышением температуры, а также при интоксикациях.