Масло, добываемое из плодов ажгона, является основным источником для получения природного тимола, который широко применяется для дезинфекции слизистых оболочек полости рта, зева и глотки, а также в стоматологии для анестезии дентина и дезинфекции, кариесных полостей. Тимол используется в гельминтологии (против анкилостом и власоглава), дерматологии (при лечении ряда грибковых заболеваний), в лекарственной парфюмерии (входит в состав лечебных полосканий, мыла, зубной пасты), широко используется в составе аэрозолей лечебного и лечебно-профилактического направления.